Son activité s’articule autour de 3 grandes missions :
La Protection des espèces : par l’évaluation du statut des espèces grâce à la réalisation d’inventaires et d’enquêtes ; par la mise en place de Plans d’Actions dont le but est la conservation des espèces les plus menacées ; par la Mission Rapaces qui vise à préserver l’ensemble des populations de rapaces et programmer des réintroductions pour les populations les plus faibles et par le programme Faune Sauvage en Détresse qui consiste à soigner les animaux dans le but de les relâcher dans leur milieu.
La Préservation des espaces : la LPO est gestionnaire de 169 espaces naturels dont 12 Réserves Naturelles Nationales et 7 Réserves Naturelles Régionales, elle est active dans 507 sites Natura 2000, participe et se positionne pour une agriculture durable et porte le programme Des Terres et des Ailes. Elle anime le premier de jardins écologique de France avec 25500 Refuges LPO partout en France.
L’Éducation et la sensibilisation : la LPO édite des revues naturalistes et met en place des actions pédagogiques et de sensibilisation, pour les scolaires ou le grand public, destinées à faire découvrir les secrets de la nature, sa vulnérabilité et les moyens de la protéger.
